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Sophie MERLIN

En résumé

Technicienne Recherches en Biologie Moléculaire

Mes compétences :
1er secours

Entreprises

  • Genes Diffusion - Technicienne Recherches en Biologie Moléculaire

    2009 - maintenant Préparation de libriairies pour technologies Hiseq, Miseq ILLUMINA
    Analyse Métagenomique
    Séquençage sur PGM IonTorrent (Certification CSPro)
    Utilisation de l'outil Galaxy pour le traitement de données genomique
    Génotypages via Technologie Infinium ILLUMINA (Certification CSPro)
    Génotypages via Technologie GoldenGate ILLUMINA
    Gestion d'échantillons
    Diagnostics qPCR, PCR
    Extraction, Dosage d'ADN & d'ARN
    Développement et Veille technologique
    Encadrement/Formation de stagiaires et techniciens
    Gestion des commandes et stocks


    PUblications/Poster:

    Poster ECCB 2014:
    Alexandre Loywick, Gael Even, Sophie Merlin, Renaud Blervaque and Christophe Audebert
    A targeted metagenomic analysis pipeline dedicated to Ion Torrent PGM Data
    https://wiki.galaxyproject.org/Events/ECCB2014

    Seesao Y, Audebert C, Verrez-Bagnis V, Merlin S, Jérôme M, Viscogliosi E, Dei-Cas E, Aliouat-Denis CM, Gay M. Monitoring of four DNA extraction methods upstream of high-throughput sequencing of Anisakidae nematodes.
    JMicrobiol Methods. 2014 May 15

  • Laboratoire de Physiopathologie de la Barrière Hemato-Encephalique (LBHE) - Technicienne Recherche

    2006 - 2009 Culture cellulaire
    Screening et analyses de composés en HPLC/MS post-traitement in vitro (contrats Européens : Acute-tox (FP6) : LSHB-CT-2004-512051, BBB-Follow-up : CCR-ICMP 431931XO et Predict iv (FP7) :202222)
    Gestion d’analyses en nano-chromatographie liquide pour la plateforme protéomique du laboratoire
    Screening de composés, pour des contrats avec l’industrie pharmaceutique, mise en conditions d’ischémie et de normoxie (in vitro).
    Rédactions de rapports
    Organisation de séminaire
    Création d’une base de données interne au laboratoire
    Encadrement de stagiaires
    Gestion de commandes et des stocks

  • Faculté des sciences Jean Perrin - Préparatrice TP

    2005 - 2006 Préparation de TP de :
     Biochimie
     Microbiologie
     Biologie Moléculaire
     Biologie Cellulaire
    Gestion des commandes et des stocks

  • Protéaxis - Stagiaire

    2004 - 2004 Etude de différentes techniques d’extraction et d’identification de protéines chez E. coli

  • Laboratoire de Physiopathologie de la Barrière Hemato-Encephalique (LBHE) - Stagiaire

    2003 - 2004 Influence de la méthode de récupération des cellules endothéliales de capillaires cérébraux bovins sur le profil d’électrophorèse bidimensionnelle de leur proteome cytosolique.

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