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Ysabelle ADOLPHE

LIÈGE

En résumé

Management : coordinatrice de projets européen & wallon, gestion de consortia européen & wallon, gestion d’équipes, encadrement, sens de l’écoute, établissement et suivi des objectifs, animation de réunions, recrutement

Gestion de projet : création d’un consortium européen, écriture de projets européens, planification et réalisation des tâches, gestion de budget, gestion des imprévus, respects des délais

Microbiologie : Techniques traditionnelles, création de nouveaux milieux et de milieux sélectifs, isolement et identification, tests physiologiques & antibiogrammes, études sur les bactéries, les levures et les champignons filamenteux, challenge tests, création de microcosms

Biochimie : Lyophilisation, analyses de protéines, chromatographie, Western Blot, techniques d’immunologie

Biologie moléculaire : Métagénomique, RT-qPCR, extraction d’ADN, séquençage, puces à ADN, analyses de séquençages, design d’amorces et de sondes

Autres compétences scientifiques : Plans d’expériences (réseaux de Doelhert), normes, dégustations & analyses sensorielles

Langues étrangères : anglais (bilingue), espagnol (notions)


Mes compétences :
Microbiologie
Biochimie
Chercheur
Biotechnologie
Environnement
Management d'équipe
Management de projets
Montage de projets
Sécurité alimentaire
Biologie moléculaire

Entreprises

  • Lonza Group - European Product Support Specialist

    2014 - maintenant
  • Département des Sciences des Denrées Alimentaires - Responsable Projet

    2009 - 2014 Laboratoire des Sciences des Denrées Alimentaires (DDA), Faculté Médecine Vétérinaire, Liège
     Projet Région Wallonne : Allongement de la durée de vie des produits alimentaires par la compréhension et la maîtrise des mécanismes responsables de leurs altérations (CONSALIM)
    Collaborations scientifiques : Région Wallonne, UCL, Université de Gembloux, CRA-W, Celabor
    Collaborations industrielles : Detry, Millioni, Belourthe, Lutosa
    Travail rédactionnel : rapports d’activités semestriels, rapports scientifiques annuels, communications scientifiques écrites et orales
    Gestion d’équipe : 1 ingénieur de recherche, 2 techniciens
    Budget : 6,4 M€ dont 0,9 M€ pour le DDA
    Formations aux industriels


     Projet européen FP7-KBBE (coordinatrice) : Fast & Reliable Innovative Detection On Molecular Technology (FRIDOM Tech) – Mise à disposition des entreprises des outils moléculaires pour l’amélioration de la qualité
    Collaborations scientifiques : ULg (BE), ACTIA (FR), ANSES (FR), CRA-W (BE), Université de Turin (IT), CINUSA (ES), Université de Guelph (CA)
    Collaborations industrielles : ARTTIC (BE), Bio-Rad (FR), Carrefour (BE), IPad Lab (IT), KSL (TR), Leogriff (NO), Milioni (BE), Quality Partner (BE)
    Travail rédactionnel : création et réécritures de la proposition de projet à l’Europe
    Budget : 3 M€

     Projet Région Wallonne (coordinatrice) : Fraicheur des Aliments par l’Innovation du Conditionnement Haute pression (FRAICH Tech)
    Collaborations scientifiques : Université de Gembloux, Celabor
    Collaborations industrielles : Detry, Puratos, Mamma Lucia, Upignac, Spadel, Fresh Concept, AMIFOOD, Hiperbaric, CER Groupe, Cide-Socran
    Travail rédactionnel : création et réécritures de la proposition de projet, étude de marchés
    Budget évalué : 5,5 M€

     Projet européen COST (coordinatrice) : Utilisation d'écosystèmes microbiens comme leviers novateurs pour réduire et contrôler les pertes et déchets alimentaires
    Collaborations scientifiques : ULg (BE), ACTIA (FR), CERELA (AR), CMBI (NL), CNRS (FR), CSIC Madrid (ES), DTU (DA), IFREMER (FR), INRA (FR), IRTA Monnels (ES), NOFIMA (NO), Tegasc (IR), Université de Copenhague (DA), Université de Napples (IT), Université de Turin (IT), VUB (BE),
    Collaborations industrielles : Fischeries (DA), Nizo Food Research (NL), Quality Partner (BE)
    Travail rédactionnel : création et réécritures de la proposition de projet, étude de marchés
  • CRECEP / CEREVE, Paris, France - Chargée de Recherche

    2008 - 2009 Mission : Mise en place de nouvelles méthodes biologiques de dégradation des graisses.

    Les déchets graisseux issus de la restauration restent à l’heure actuelle une question délicate et l’obligation de prétraitements des effluents n’a pas entièrement résolu le problème. Les principales raisons de cet échec sont un dimensionnement inadapté des Séparateurs A Graisses (SAG), souvent combiné à un mauvais entretien. Ceci conduit inévitablement à un déversement des déchets dans le réseau.

    Afin d’améliorer le traitement des graisses (et notamment leur élimination), l’idée est venue de combiner le lieu de concentration des déchets à leur dégradation (SAG biologique). Ainsi, il existe sur le marché des bio-additifs renfermant une association de micro-organismes et d’enzymes à inoculer dans les SAG. Ces derniers vont, en théorie, permettre aux industriels de détruire partiellement leurs déchets graisseux. En pratique, l’efficacité de ces bio-additifs reste controversée. En effet, d’une part, l’acclimatation des bactéries au milieu reste difficile du fait de la variabilité de l’environnement (pH, température, composition en nutriments) et, d’autre part, ces dernières sont bien souvent lessivées lors du passage des eaux de lavage.

    Afin de contrecarrer les difficultés liées à l’utilisation de telles bactéries dans les SAG, le projet prévoit l’usage, comme bio-additifs, d’une communauté de bactéries indigènes aux bacs à graisses. Cette utilisation de bio-additifs serait combinée à une réorganisation interne des SAG pour un maintien optimal de la communauté bactérienne.
    L’étude s’articule autours de trois axes majeurs : l'étude de la communauté bactérienne (génétique et physiologique) présente dans les SAG, la détermination de l’activité lipasique de ces mêmes bactéries et la création d'un communauté microbienne idéale à la réduction des résidus graisseux des SAG.

    Collaboration : Eau De Paris, CEREVE, ESPCI, SIAAP, St-Dizier Environnement, Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité
    Gestion d’équipe : 4 Maîtres de Conférences, 5 Ingénieurs d’Etude, 2 analystes, 2 doctorants, 3 Masters 2 et 2 techniciens
    Encadrement : 3 stagiaires de Master 2 (3 x 6 mois)
  • UBO/ESMISAB, Brest, France (Laboratoire Universitaire de Biodiversité et Ecologie Microbienne) - Chargée de Recherche

    2007 - 2008 Mission : Etude de nouveaux taxons de champignons filamenteux des hauts fonds marins, recherche d’enzymes connus ou de nouveaux enzymes à intérêt industriel.

    Depuis leur découverte dans les années 1970, les sources hydrothermales marines profondes ont été largement étudiés d’un point de vue chimique, géologique et biologique. A la même période, plusieurs travaux scientifiques se sont concentrés sur l’étude des champignons marins. Cependant, ces observations se sont uniquement focalisées sur les mangroves, les littoraux et l’océan de surface. Dans ces environnements, les champignons marins ont été étudiés en premier lieu d’un point de vue technologique mais l’aspect biotechnologique s’est vite imposé notamment pour la recherche de métabolites d’intérêt.
    Très récemment, plusieurs études s’intéressant aux communautés des micro-eucaryotes présents dans les environnements extrêmes ont mis en évidence des séquences nucléotidiques fongiques, preuve de la présence indéniable de tels organismes dans les sources hydrothermales profondes. Notre étude basée sur l’analyse des souches fongiques marines cultivables issues des sources hydrothermales a permit la réalisation d’une collection de souches : 92 champignons filamenteux et 35 levures. Cette collection de souches fongiques filamenteuses est la première jamais réalisée à partir d’échantillons minéraux et animaux de sites hydrothermaux. Une précédente étude (2005) a étudié la diversité des levures au niveau de sources hydrothermales profondes mais uniquement à partir d’échantillons minéraux.
    Notre collection peut être diviser en deux groupes en se basant sur des analyses physiologiques : 1) Une majorité de souches psychrotrophes qui indique une adaptation à ces écosystèmes froids (environ 4°C) et donc un éventuel endémisme ; 2) Une minorité de souches mésophiles qui indique la présence d’une flore fongique non adaptée aux grands fonds vraisemblablement à l’état de survie dans ces écosystèmes. L’analyse génétique permet de confirmer nos hypothèses d’endémisme : les souches mésophiles sont des souches couramment isolées en milieu terrestre et donc non-endémique et les souches psychrotrophes apparaissent comme taxonomiquement originales ce qui semble confirmer leur endémisme.
    L’analyse de la synthèse enzymatique des souches de cette collection va permettre d’obtenir des indications quant à leur rôle écologique dans ces écosystèmes. Mais l’aspect biotechnologique est également envisagé avec de potentielles activités intéressantes à basse température de ces enzymes issues de souches psychrotrophes.
    Un travail préliminaire a été effectué sur 4 champignons filamenteux taxonomiquement originaux et 4 levures. Suite à une dégradation de la membrane cellulaire via l’utilisation d’une Presse de French (4,75 kBar) ainsi qu’une ultra-filtration sur membrane 4kDa, une analyse de l’acticité enzymatique a été réalisée sur galeries API-ZYM (Biomérieux). L’analyse des enzymes intra et extracellulaires à permit l’obtention de résultats encourageants avec la visualisation de fortes activités phosphatase, estérase, lipase, hydrolase et osidase. L’analyse quantitative des activités est actuellement en cours ainsi que la mise au point de protocoles de détection d’activités xylanase, chitinase, cellulase et amylase.
  • UHA, Colmar, France (Laboratoire Vignes Bioprocédés Environnement) - Chargée de Recherche

    2005 - 2006 Missions : Etude du phénomène de stress des levures œnologiques engendré par la présence d’acides gras à chaînes moyennes.

    La chaîne moyenne des acides gras est bien connue comme des inhibiteurs de fermentation. Pendant la majeur partie de la fermentation, la toxicité de ces acides gras est augmentée par l'éthanol et le pH bas, qui favorise leur entrée dans la cellule, aboutissant à une diminution du pH interne. L'exposition à ces acides augmente la résistance des levures, en raison de l'induction d'un transporteur de membrane non caractérisé jusqu'à présent.
    Les gènes probablement impliqués dans la réponse aux acides octanoïque et decanoïque ont été identifiés tant par l'analyse du transcriptome que le la sélection au sein la bibliothèque génomique. L'analyse phénotypique de 70 souches a été utilisée pour confirmer l'implication de ces gènes.
    Les deux inhibiteurs induisent une activité de gènes se chevauchant partiellement . La réponse causée par le stress de l'acide octanoïque peut être décrite principalement comme une réponse acide faible qui implique PDR12 comme transporteur principal dans le contrôle de WAR1. Le rôle de ce transporteur a été confirmé par l'analyse phenotypique d'une souche délettée de Pdr12, aussi bien l'induction de mRNA de PDR12 que la compétition pour l'extrusion de la fluorescéine en présence d'acide octanoïque.Dans le contraste la réponse à l'acide decanoïque ressemble à une réponse de stress oxydatif dans le contrôle d'YAP1. L'adaptation à l'acide décanoïque implique le transporteur MSF TPO1 et, de manière moins importante, TPO4. En outre l'induction de FAA1 et l'alcool acyltransferase EEB1 suggère un sentier de désintoxication par la production d'ester d'éthyle decanoate. La duplication de TPO1 dans la levure de vin suggère que l'adaptation à la fabrication de vin ait favorisé l'amplification de ce gène.
  • INPL, Nancy, France (Laboratoire des Sciences et du Génie Alimentaires) - Chargée de Recherche

    2002 - 2005 Mission : Etude du système lactoperoxydasique et validation de son effet inhibiteur sur la flore du poisson.

    Le système lactoperoxydasique (LP-s) est composé de deux enzymes, la lactoperoxydase (LPO) et la glucose oxydase (GOD) et de ses deux substrats le glucose et le thiocyanate (SCN-). L'étude des réseaux uniformes de Doehlert a conduit à la compréhension des interactions entre les constituants du LP-s et à l'optimisation de leur concentration. A 25 °C, la peroxydation du SCN- est augmentée par le glucose et la LPO, et est affectée par les interactions GOD/glucose, GOD/pH et LPO/pH. Le LP-s optimisé avec une concentration initiale en SCN- de 50 mg.I-1 est composé de 85,5 UI.I-1 de GOD, de 1,5 g.I-1 de glucose et de 3930 UI.I-1 de LPO avec un pH initial de 6,5.
    Un milieu modèle poisson stérile (« liquide » et gélosé) a été créé pour cette étude à partir de filets de truites arc-en-ciel, élevées en aquaculture continentale.
    Quatre souches ont été sélectionnées des flore pathogène et d'altération du poisson : Listeria monocytogenes, Brochothrix thermosphacta, Carnobacterium. maltaromaticum et de Shewanella putrefaciens. L'activité inhibitrice de ce LP-s optimisé a été expérimentée sur la croissance ces quatre souches en cultures pures et mixtes, à 4 °C, en milieu TSB-YE (milieu de laboratoire, optimal de croissance) et en milieu modèle poisson. En milieu TSB-YE et en cultures pures et mixtes, L. monocytogenes DSM 20600T est la plus affectée par la présence du LP-s. En milieu modèle et en cultures pures, la croissance des quatre souches tests est très affectée par la présence du LP-s. En milieu modèle et en culture mixte, les croissances de S. putrefaciens CIP 80.40T,
    L. monocytogenes DSM 20600T et B. thermosphacta DSM 20171T sont totalement inhibées. Dans ces dernières conditions, le LP-s a un effet uniquement bactériostatique sur la croissance de
    C. maltaromaticum DSM 207001T. A 4 °C, en milieu modèle poisson et en culture mixte, un effet bactériostatique et/ou bactériolytique permet de maintenir la population bactérienne en dessous du seuil des normes pendant 12 jours complets, temps des expérimentations.
  • INPL, Nancy, France (Laboratoire Bioprocédés Agro-ALimentaires) - Chargée de Recherche

    2001 - 2002 Mission : Capacités technologiques de bactéries lactiques atypiques.
    Des souches bactériennes appartenant au genre Carnobacterium ont été isolées au LABIAL de fromages à pâte molle au lait cru, en fin d’affinage. Ces souches lactiques ne sont jamais présentes dans les levains commerciaux proposés aux industriels laitiers. Des espèces appartenant à ce genre bactérien pourraient être utilisées en complément de levains lactiques traditionnels. Une première série de tests à permis d’évaluer la capacité de 33 souches de la collection LABIAL à cultiver sur des milieux à base de lait. Des analyses sensorielles et physico-chimiques ont permis une sélection au sein de cette collection. Ainsi 3 souches du genre Carnobacterium ont été retenues. Cette présélection a permis d’écarter des souches inadaptées au substrat lait (vitesse de coagulation, flaveurs des caillés), même modifié par ajout du glucose, de galactose et/ou d’hydrolysats. L’analyse du comportement des souches lors de co-cultures associant Leuconostoc lactis 144, espèce utilisée en production fromagère, et une souche lactique atypique, permet de déterminer si elles modifient favorablement ou non les qualités organoleptiques et texturales des caillés. Les techniques de fabrication type « Caprice des dieux », « Géramont » et « Montagnard » ont donné des résultats prometteurs et le département de Recherche et Développement de Bongrain – Gérard S.A.S. a préconisé des co-cultures avec des souches de leur collection avec ces trois souches. C. p. 28. ainsi que C. d. 586 sont maintenant ajoutées à la fabrication du « Montagnard » de chez Bongrain - Gérard S.A.S..

Formations

  • Institut National Polytechnique

    Vandoeuvre Les Nancy 2001 - 2006 Procédés Biotechnologiques et Alimentaires

    DEA - Doctorat
  • Faculté Des Sciences Université Henri Poincaré I (Vandoeuvre Lès Nancy)

    Vandoeuvre Lès Nancy 1998 - 2001 Biochimie

    Licence - Maîtrise
  • IUT Du Montet (Villers Lès Nancy)

    Villers Lès Nancy 1996 - 1998 Analyses Biologiques et Biochimiques

Réseau

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