Julien Simonet

- Gestion de projets relatifs à l’étude, au développement et à la production de matériaux de référence en microbiologie (bactéries et virus) et biologie moléculaire.
- Mise en place du laboratoire de virologie (organisation, achats des consommables, équipements…)
- Développement de méthodes pour la détection de microorganismes pathogènes ainsi que d'approches pour la standardisation des techniques de biologie moléculaire.
- Evaluation, interprétation et synthèse des données issues des expérimentations du laboratoire, des campagnes de certification ainsi que des exercices d'évaluation.
- Réalisation d'investigations en cas de non-conformités ou de problèmes avec les matériaux de référence dans le domaine de la microbiologie.
- Encadrement et formation du personnel technique.
- Rédaction de rapports, publications et communications.


Collaborations :
Laboratoire de référence de l'Union Européenne pour Campylobacter (National Veterinary Institute, Sweden)
Laboratoire de référence de l'Union Européenne pour le suivi et le contrôle de la contamination bactérienne et virale des mollusques et bivalves (CEFAS, UK)


http://irmm.jrc.ec.europa.eu/html/homepage.htm

Projet ANR sur les légionelles.
Post-doctorant puis Attaché temporaire d'enseignement et de recherche (ATER)

- Gestion de plusieurs projets dédiés aux Légionelles, avec notamment la gestion d'un projet ANR (thématique 1).
- Développement et comparaison de techniques de détection afin d'évaluer la persistance des Légionelles dans l'environnement (réservoir) ainsi que dans les aérosols (voie de contamination).
- Développement et optimisation de techniques classiques (culture cellulaire, coinfection avec amibes) et innovantes (microélectrophorèse, AFM…) afin d'étudier les paramètres influençant les premières étapes de l'adhésion des Légionelles lors de l'infection, mais aussi dans l'environnement (adhésion, biofilms...).
- Mise en place d'une souchotèque de Légionnelles comprenant des souches parentales et mutants.
- Encadrement et formation de personnel technique et de stagiaires.
- Rédaction de rapports, publications et communications.


Collaborations :
- Centre Scientifique et Techniques du Bâtiment (CSTB, Champs-sur-Marne)
- Centre National de Référence des Légionelles (CNRL, Lyon)
- Laboratoire de Chimie-Physique et Microbiologie pour l'Environnement (LCPME, Nancy)
- Laboratoire Environnement et Minéralurgie (LEM, Nancy)



http://www.ephe.sorbonne.fr/

- Gestion et participation à la coordination du projet « UV/virus » résultant d’un partenariat Industrie-Université.
- Mise en place d’un pilote/benchscale UV mobile reproduisant un traitement de désinfection par UV.
- Etude de l'inactivation par les UV de pathogènes ainsi que d’indicateurs de contamination fécale d’origine virale (phages) avec des techniques classiques (cultures cellulaires) et des techniques innovantes (RT-PCR en temps réel, quantitative…).
- Etude des paramètres physico-chimiques (pH, présence de sels, phénomènes d’adhésion-agrégation…) influençant le comportement des particules virales ainsi que l’efficacité du traitement de désinfection (inactivation virale).
- Etude de la cible principale des UV au niveau de la particule virale (capside et génome) par l’intermédiaire de techniques innovantes (Zetasizer Nano, RT-PCR…).
- Développement et optimisation de systèmes PCR (technologie Taqman et SYBR Green).
- Encadrement de stagiaires.
- Rédaction de rapports, publications et communications.



http://lcpe.cnrs-nancy.fr/index2.html

Mise en place et implémentation d'une nouvelle norme AFNOR concernant le contrôle qualité et la validation des milieux de culture pour la détection de bactéries.

Agent qualité.
Réalisation des analyses microbiologiques des échantillons d'eau dans le cadre du contrôle qualité.