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Alice NAVE DUFOUR

Kortrijk

En résumé

Mes compétences :
Imagerie médicale
Morphologie mathématique
Traitement d'image
Programmation orientée objet
IRM
ARM
Programmation C/C++

Entreprises

  • Barco - Ingénieur recherche

    Kortrijk 2015 - maintenant
  • Université Lille 2 Droit Et Sante - Post-doctorat

    Lille 2014 - 2015
  • Université de Strasbourg - Attachée Temporaire de l'Enseignement et de la Recherche (ATER)

    Strasbourg 2012 - 2014 Enseignement de l'informatique :
    - UFR Mathématique-Informatique : Master Biologie structurale, bioinformatique et biotechnologies : Base de données, Modélisation objet (UML), Programmation orientée objet.
    - IUT Robert Schuman : Comprendre et manipuler les systèmes, Conception des structures de données.

    Recherche :
    - Continuité du travail de thèse concernant la modélisation vasculaire cérébrale
    - Participation au projet ANR Vivabrain
  • CNRS, Université de Strasbourg - Doctorante

    2009 - 2013 Titre : Segmentation et modélisation des structures vasculaires en imagerie médicale 3D

    Axes de recherche -

    Les objectifs de cette thèse se sont articulés autour de deux thématiques respectivement liées à la segmentation et à la modélisation des vaisseaux cérébraux à partir de données angiographiques 3D. Les travaux en segmentation se sont inscrits dans une démarche classique d'extraction de connaissance relative aux vaisseaux sanguins. Les travaux en modélisation -- thématique beaucoup plus récente -- se sont inscrits dans une optique visant à développer des "atlas vasculaires" susceptibles de formaliser une connaissance anatomique précise à des fins diverses allant de l'enseignement de la médecine au guidage d'outils de traitement ou d'analyse d'images.
    Les travaux réalisés en segmentation sont basés sur un compromis entre méthodes interactive (souvent coûteuses en temps pour l'utilisateur) et méthodes automatiques (rapides mais peu fiables), en utilisant le concept de segmentation à base d'exemples. L'exemple permet d'obtenir de manière automatique une pré-segmentation de l'image 3D, qui est utilisée par l'expert pour obtenir une segmentation correcte. Les travaux réalisés en modélisation ont pour but la modélisation d'un atlas vasculaire cérébral probabiliste regroupant les informations de position, de taille et d'orientation, une discrimination veines/artères, ainsi qu'un étiquetage des vaisseaux. L'utilisation d'un atlas de structures morphologiques permet une amélioration, ainsi qu'un enrichissement des données à modéliser.

    Implémentation -

    L'ensemble des travaux a été implanté dans un logiciel nommé MediPy. Ce logiciel est dédié à la visualisation et aux traitements de données médicales 2D et 3D. Il est basé sur l'utilisation de bibliothèques existante telles que ITK, Numpy, Scipy et VTK. Les langages de programmation utilisés sont le C++ et le python.

  • Laboratoire d'Imagerie et Neurosciences Cognitives - Stagiaire

    2009 - 2009 Titre : Filtrage des artéfacts d'écoulements vasculaires en IRMf.

    L'objectif de ce stage a été de déterminer l'influence de la vascularisation du cerveau sur l'activité cérébrale détectée en IRMf, afin de la réduire. Ces travaux ont présenté une première approche de l'utilisation d'atlas vasculaires cérébraux afin d'améliorer la détection d'activité cérébrale en IRMf.

    La finalité de ce stage a été la réalisation d'une boîte à outils MatLab permettant de filtrer ces artéfacts.
  • Salt Lake University - Stagiaire en imagerie médicale

    2007 - 2008 J'ai travaillé sur trois projets principaux :
    - Segmentation des ventricules cérébraux chez les nouveau-nés ;
    - Modification d'un pipeline pour la création d'atlas de DTI ;
    - Atlas de carte d'activation chez les enfants.

    Ces projets ont été réalisés en C++ en utilisant la bibliothèque spécifique aux images médicales ITK.

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